Советую послать турагенство лесом и оформлять визу самим. В эстонское консульство можно отправлять анкеты через пони экспресс, так что вопрос удаленности не актуален. Сам процесс несложен и многократно разжеван в Интернете.
Турагенство 100% просто впишет вас в какую-нибудь экскурсию по прибалтике, а после получения визы бронь снимет. Поэтому их и машина ваша не интересует. Но в консульстве это отслеживают и не любят. Знаю лично случаи, когда потом у людей бывали проблемы с получением следующей визы.
astrushkin